许可证系统使得空气质量管理系统能够更加简单的强调固定排放源的污染问题。在没有许可证系统这种形式的时候，如果执行环境符合性系统的政府想停止某个制造污染的公司的运行，在世界上大多数地区，这种情况下法律要求政府机构必须证明该公司必须停止制造污染。这将会花更长的时间，而且使得符合性控制机构要得到更高的证据水平。在另一方面，如果公司必须得到操作和排放的某种形式的许可证的话，发放该执照的政府机构就可以用更简单的程序以及更低的取证任务来停止制造污染的公司的运行。操作执照，或者称许可证，详细讲述了公司为了继续运行必须达到的污染限度和相关的因素。如果公司被怀疑跟该许可的条件相冲突，那么操作执照就会被取消，这就使得公司处在一种向机构提供它保持跟环境的符合性的地位。因此，大多数的环境符合性系统都已经建立起了某些形式的许可证系统，用以支持它们维持符合性的操作。



许可证通常按以下三种形式发放出去：

1. 建造许可证

2. 运营临时许可证

3. 运营许可证

建造许可证是制造污染的公司在建造新的设施或者是扩大已有的设施时所必须得到的许可证。对于一个公司而言，如果改动并不会影响到它的气体排放量的话，它就不需要建造许可证。直到环境符合性机构发放了建造许可证之后，公司才可以开始建造新的设施。

运营临时许可证是制造污染的公司为了示范它的新设施或者是扩大后的设施时所必须得到的许可证。该许可证通常有效期只有一年，在特殊情况下也可以延长有效期。当新设施或者是扩大后的设施在完成所需要的排放测试时，运营临时许可证就可以派上用场。环境符合性机构就有机会确认该公司是在跟建造许可证符合的情况下在操作。

一旦环境符合性机构确认公司是在跟相关要求相符合的条件下运营时，就会给它们发放运营许可证。运营许可证有效期通常是一年，最多两年。

此外，许可证系统对于符合性系统的好处是这样的，许可证系统可以作为基础，通过收集税收来支持符合性系统。这一点将会在下一节中深入的讨论。